MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus sp. Y412MC10 chromosome

Total Repeats: 119499

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013406	CGT	2	6	288	293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403877
2	NC_013406	GGT	2	6	372	377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261403877
3	NC_013406	GCA	2	6	438	443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403877
4	NC_013406	CGC	3	9	449	457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261403877
5	NC_013406	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403877
6	NC_013406	TGC	2	6	552	557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403877
7	NC_013406	CTCG	2	8	558	565	0 %	25 %	25 %	50 %	261403877
8	NC_013406	TGG	2	6	612	617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261403877
9	NC_013406	ATGC	2	8	643	650	25 %	25 %	25 %	25 %	261403877
10	NC_013406	CAG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403877
11	NC_013406	TCC	2	6	703	708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403877
12	NC_013406	TCA	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403877
13	NC_013406	CAA	2	6	768	773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403877
14	NC_013406	AGG	2	6	839	844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403877
15	NC_013406	C	6	6	910	915	0 %	0 %	0 %	100 %	261403877
16	NC_013406	GAA	2	6	934	939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403877
17	NC_013406	CCG	2	6	985	990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261403877
18	NC_013406	AAG	2	6	1021	1026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403877
19	NC_013406	CGAA	2	8	1052	1059	50 %	0 %	25 %	25 %	261403877
20	NC_013406	ATG	2	6	1063	1068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403877
21	NC_013406	GTC	2	6	1126	1131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403877
22	NC_013406	TCC	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403877
23	NC_013406	ATC	2	6	1195	1200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403877
24	NC_013406	GCCG	2	8	1208	1215	0 %	0 %	50 %	50 %	261403877
25	NC_013406	CAA	2	6	1240	1245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403877
26	NC_013406	TTCCC	2	10	1362	1371	0 %	40 %	0 %	60 %	261403877
27	NC_013406	TCAT	2	8	1412	1419	25 %	50 %	0 %	25 %	261403877
28	NC_013406	TGA	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403878
29	NC_013406	A	6	6	1732	1737	100 %	0 %	0 %	0 %	261403878
30	NC_013406	CAGC	2	8	1848	1855	25 %	0 %	25 %	50 %	261403878
31	NC_013406	GGA	2	6	1891	1896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403878
32	NC_013406	AGC	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403878
33	NC_013406	TGC	2	6	1941	1946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403878
34	NC_013406	TTC	2	6	1955	1960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403878
35	NC_013406	TTC	2	6	2032	2037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403878
36	NC_013406	GGA	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403878
37	NC_013406	CAAA	2	8	2152	2159	75 %	0 %	0 %	25 %	261403878
38	NC_013406	TAT	2	6	2208	2213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403878
39	NC_013406	CAA	2	6	2311	2316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403878
40	NC_013406	TAT	2	6	2409	2414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403878
41	NC_013406	GTTCT	2	10	2429	2438	0 %	60 %	20 %	20 %	261403878
42	NC_013406	ATT	2	6	2480	2485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403878
43	NC_013406	A	7	7	2521	2527	100 %	0 %	0 %	0 %	261403878
44	NC_013406	TCGA	2	8	2537	2544	25 %	25 %	25 %	25 %	261403878
45	NC_013406	GGC	2	6	2609	2614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403878
46	NC_013406	TCC	2	6	2633	2638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403878
47	NC_013406	GAA	2	6	2657	2662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403878
48	NC_013406	GGT	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261403878
49	NC_013406	AAC	2	6	2751	2756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403878
50	NC_013406	TGA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403878
51	NC_013406	ATC	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403878
52	NC_013406	CGA	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403878
53	NC_013406	AT	3	6	2824	2829	50 %	50 %	0 %	0 %	261403878
54	NC_013406	CCGTA	2	10	2837	2846	20 %	20 %	20 %	40 %	261403878
55	NC_013406	AT	3	6	2922	2927	50 %	50 %	0 %	0 %	261403879
56	NC_013406	GCT	2	6	2988	2993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403879
57	NC_013406	ACG	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403879
58	NC_013406	GAAG	2	8	3024	3031	50 %	0 %	50 %	0 %	261403879
59	NC_013406	GCG	2	6	3033	3038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403879
60	NC_013406	GCA	2	6	3100	3105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403879
61	NC_013406	TTGT	2	8	3168	3175	0 %	75 %	25 %	0 %	261403880
62	NC_013406	GCA	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403880
63	NC_013406	ATC	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403880
64	NC_013406	TGCT	2	8	3301	3308	0 %	50 %	25 %	25 %	261403880
65	NC_013406	AT	3	6	3373	3378	50 %	50 %	0 %	0 %	261403880
66	NC_013406	CAG	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403880
67	NC_013406	GAA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403880
68	NC_013406	AGC	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403880
69	NC_013406	GCTC	2	8	3493	3500	0 %	25 %	25 %	50 %	261403880
70	NC_013406	CCG	3	9	3557	3565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261403880
71	NC_013406	GCA	2	6	3617	3622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403880
72	NC_013406	CAA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403880
73	NC_013406	CTG	2	6	3654	3659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403880
74	NC_013406	GCA	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403880
75	NC_013406	AAG	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403880
76	NC_013406	A	6	6	3767	3772	100 %	0 %	0 %	0 %	261403880
77	NC_013406	CATC	2	8	3794	3801	25 %	25 %	0 %	50 %	261403880
78	NC_013406	CT	3	6	3828	3833	0 %	50 %	0 %	50 %	261403880
79	NC_013406	GGA	2	6	3863	3868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403880
80	NC_013406	AGA	2	6	3869	3874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403880
81	NC_013406	GAT	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403880
82	NC_013406	AAG	2	6	3997	4002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403880
83	NC_013406	CAG	2	6	4026	4031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403880
84	NC_013406	GAC	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403880
85	NC_013406	TGC	2	6	4102	4107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403880
86	NC_013406	GAT	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403880
87	NC_013406	TCA	2	6	4189	4194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403880
88	NC_013406	GA	3	6	4313	4318	50 %	0 %	50 %	0 %	261403881
89	NC_013406	ATC	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403881
90	NC_013406	CAG	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403881
91	NC_013406	GTG	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261403881
92	NC_013406	ATCG	2	8	4470	4477	25 %	25 %	25 %	25 %	261403881
93	NC_013406	ATG	2	6	4594	4599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403882
94	NC_013406	GTAT	2	8	4651	4658	25 %	50 %	25 %	0 %	261403882
95	NC_013406	CAT	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403882
96	NC_013406	GAA	2	6	4835	4840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403882
97	NC_013406	CGG	2	6	4877	4882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403882
98	NC_013406	GGC	3	9	4890	4898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403882
99	NC_013406	CGG	2	6	4913	4918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403882
100	NC_013406	CAG	2	6	5001	5006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403882
101	NC_013406	ATC	2	6	5011	5016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403882
102	NC_013406	GCG	2	6	5017	5022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403882
103	NC_013406	CGA	2	6	5057	5062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403882
104	NC_013406	ACG	2	6	5112	5117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403882
105	NC_013406	ACC	2	6	5130	5135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403882
106	NC_013406	GACG	2	8	5192	5199	25 %	0 %	50 %	25 %	261403882
107	NC_013406	ACT	2	6	5218	5223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403882
108	NC_013406	ATC	2	6	5241	5246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403882
109	NC_013406	GAA	2	6	5270	5275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403882
110	NC_013406	AAT	2	6	5388	5393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403882
111	NC_013406	GC	3	6	5437	5442	0 %	0 %	50 %	50 %	261403882
112	NC_013406	ATC	2	6	5451	5456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403882
113	NC_013406	GAC	2	6	5514	5519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403882
114	NC_013406	CGG	2	6	5671	5676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403882
115	NC_013406	CCG	2	6	5681	5686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261403882
116	NC_013406	CTC	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403882
117	NC_013406	TCG	2	6	5842	5847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403882
118	NC_013406	CGG	2	6	5861	5866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403882
119	NC_013406	CAT	2	6	5984	5989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403882
120	NC_013406	GGA	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403882
121	NC_013406	TC	3	6	6026	6031	0 %	50 %	0 %	50 %	261403882
122	NC_013406	TGC	2	6	6100	6105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403882
123	NC_013406	TTC	2	6	6111	6116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403882
124	NC_013406	TGG	2	6	6136	6141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261403882
125	NC_013406	CCG	2	6	6168	6173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261403882
126	NC_013406	CAA	2	6	6191	6196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403882
127	NC_013406	GA	4	8	6219	6226	50 %	0 %	50 %	0 %	261403882
128	NC_013406	CGA	2	6	6230	6235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403882
129	NC_013406	ATC	2	6	6237	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403882
130	NC_013406	GAC	2	6	6323	6328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403882
131	NC_013406	GTT	2	6	6392	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261403882
132	NC_013406	TTCA	2	8	6438	6445	25 %	50 %	0 %	25 %	261403882
133	NC_013406	T	7	7	6620	6626	0 %	100 %	0 %	0 %	261403883
134	NC_013406	TCT	2	6	6632	6637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403883
135	NC_013406	GAA	2	6	6705	6710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403883
136	NC_013406	TTTC	2	8	6797	6804	0 %	75 %	0 %	25 %	261403883
137	NC_013406	T	6	6	6818	6823	0 %	100 %	0 %	0 %	261403883
138	NC_013406	CTT	2	6	6881	6886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403883
139	NC_013406	TGA	2	6	6922	6927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403883
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142	NC_013406	ATTTT	2	10	6958	6967	20 %	80 %	0 %	0 %	261403883
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146	NC_013406	GTT	2	6	7195	7200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261403883
147	NC_013406	TCA	2	6	7201	7206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403883
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149	NC_013406	GCGTAT	2	12	7289	7300	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261403883
150	NC_013406	TTTTCG	2	12	7382	7393	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	261403883
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152	NC_013406	GAA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403884
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155	NC_013406	TTG	2	6	8142	8147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261403884
156	NC_013406	TGC	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403884
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158	NC_013406	GAG	2	6	8291	8296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403884
159	NC_013406	GGT	2	6	8305	8310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261403884
160	NC_013406	CTG	2	6	8333	8338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403884
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165	NC_013406	AAC	2	6	8846	8851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403884
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175	NC_013406	AAG	2	6	9339	9344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403884
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231	NC_013406	CTGCAG	2	12	18205	18216	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261403887
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242	NC_013406	CGGC	2	8	19160	19167	0 %	0 %	50 %	50 %	261403889
243	NC_013406	TTC	2	6	19283	19288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403889
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250	NC_013406	CTG	2	6	19633	19638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403889
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253	NC_013406	GCT	2	6	19806	19811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403889
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256	NC_013406	GCG	2	6	19855	19860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403889
257	NC_013406	GC	3	6	19932	19937	0 %	0 %	50 %	50 %	261403889
258	NC_013406	GC	3	6	19945	19950	0 %	0 %	50 %	50 %	261403889
259	NC_013406	TG	3	6	19954	19959	0 %	50 %	50 %	0 %	261403889
260	NC_013406	CGA	2	6	19971	19976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403889
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262	NC_013406	CTG	2	6	20102	20107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403889
263	NC_013406	TTC	2	6	20196	20201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403889
264	NC_013406	GAA	2	6	20233	20238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403889
265	NC_013406	TGC	2	6	20273	20278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403889
266	NC_013406	GGC	2	6	20376	20381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403889
267	NC_013406	CAG	2	6	20441	20446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403889
268	NC_013406	AAT	2	6	20629	20634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403890
269	NC_013406	TATT	2	8	20645	20652	25 %	75 %	0 %	0 %	261403890
270	NC_013406	AGG	2	6	20661	20666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403890
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276	NC_013406	CAG	2	6	20931	20936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403890
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281	NC_013406	ATTG	2	8	21341	21348	25 %	50 %	25 %	0 %	261403891
282	NC_013406	TC	3	6	21380	21385	0 %	50 %	0 %	50 %	261403891
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291	NC_013406	GGA	2	6	22240	22245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403892
292	NC_013406	TCG	2	6	22252	22257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403892
293	NC_013406	CCG	2	6	22291	22296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261403892
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295	NC_013406	GCT	2	6	22363	22368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403892
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299	NC_013406	GATC	2	8	22794	22801	25 %	25 %	25 %	25 %	261403893
300	NC_013406	ATCG	2	8	22832	22839	25 %	25 %	25 %	25 %	261403893
301	NC_013406	TA	3	6	22859	22864	50 %	50 %	0 %	0 %	261403893
302	NC_013406	GCAG	2	8	22893	22900	25 %	0 %	50 %	25 %	261403893
303	NC_013406	CTG	2	6	22909	22914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261403893
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389	NC_013406	TAT	2	6	28689	28694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403899
390	NC_013406	GGA	2	6	28697	28702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403899
391	NC_013406	ACA	2	6	28757	28762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403899
392	NC_013406	CGA	2	6	28907	28912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403900
393	NC_013406	GAT	2	6	28961	28966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403900
394	NC_013406	GCTG	2	8	29009	29016	0 %	25 %	50 %	25 %	261403900
395	NC_013406	TA	3	6	29030	29035	50 %	50 %	0 %	0 %	261403900
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401	NC_013406	CGG	2	6	29309	29314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403900
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500	NC_013406	CAG	2	6	35752	35757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403907

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